在Unix shell中增加可用内存到R进程
问题描述：
我在有16 GB RAM的Unix OS上运行R进程。我正在运行一个R会话，其中我正在执行以下操作：在Unix shell中增加可用内存到R进程
我将大小约为350 MB的csv文件导入到数据框中。 然后我对上面创建的数据框执行操作，为每个唯一组选择前n个产品。
但是，当我检查此R会话占用的内存量时，它显示大约90％，然后自动会话被终止。我对UNIX上R的内存管理并不了解。 因为我的系统的操作系统有16 GB RAM，我的R会话最多可能需要700 MB（导入的CSV为350 MB，创建的新数据帧为350 MB），那么它如何使用90系统的％内存并被杀死。在Unix中分配给R进程的内存是否有一些默认限制？如果是的话，是否可以增加。任何人都可以请建议。我经历了许多类似这样的帖子，但找不到任何解决方案。
答
你没有说出你有什么Unix风格，以及它是32位还是64位。这很重要。
作为第一个测试，尝试分配的内存，你认为你应该有量，例如像
m <- rep(NA, 0.8 * 16 * 1024 * 1024 * 1024/8)
或
m <- matrix(NA, 0.8 * 16 * 1024 * 1024 * 1024/8, 1)
为16 GB，其中每个元素的8个字节，并且我们要求总数的80％不要使系统失效。
然后，一旦你知道你可以得到多少内存，就像Daniel建议的那样去思考你的方法，知道他们会花多少钱。
当你的方法创建例如两两比较的矩阵，这可以很容易地泛滥你的记忆。所以，不知道你的方法是如何工作的，很难知道。我的猜测是，它会创建一个比您预期的矩阵更大的矩阵... – 2013-02-16 13:38:11
@Daniel Fischer：从导入csv创建的我的数据框如下所示： abc 1 2 .1 1 3.45 1 4 .22 3 2.76 3 1.45 .... 然后，我从上面创建另一个数据帧，根据列c的最大值，使用以下内容为列a的每个唯一值选择前2行功能。 d 2013-02-16 14:09:41
当您在较小的示例上测试代码时，它占用了多少内存？你确实尝试过一个小例子，不是吗？因为无法用数百万行和列检查代码的正确性。制作更小的示例，绘制示例大小以防用尽RAM。 – Spacedman 2013-02-16 14:14:22