grep子目录并保存多个输出
问题描述:
我有32个目录,每个.pdb文件。我如何在这些文件上使用grep并将每个文件保存到特定的输出?grep子目录并保存多个输出
预期输出是一样的东西:
1.pdb > 1_clean.pdb
2.pdb > 2_clean.pdb
3.pdb > 3_clean.pdb
...
32.pdb > 32_clean.pdb
我尝试以下,但它没有工作:
grep -r "^ATOM" *.pdb . > *_clean.pdb
答
找到 + 壳解决方案:
find -type f -name "[0-9].pdb" -exec sh -c 'fn=$1; n=${fn##*/}; n=${n%.*}; \
grep "^ATOM" "$fn" > "${n}_clean.pdb"' _ {} \;