使用因子列熔化R data.table

问题描述:

我有以下R data.table(尽管这也应该用data.frame进行缩放)。目标是将这个data.table重塑为ggplot2中的散点图。因此,我需要重塑这个data.table有一个“因素”一栏颜色分:使用因子列熔化R data.table

> library(data.table) 
> dt 
    ID     x_A    y_A  x_B  y_B                                                 
    1: 05AC   0.81    3   0.92  2.05                                                 
    2: 01BA   0.41    5   0.63  1.8                                                 
    3: Z1AC   0.41    5   0.58  1.8                                                 
    4: B2BA   0.21    6.5   1.00  1.8 
    .... 

我相信正确的输出需要的形式为:

ID  type x  y 
05AC A  0.81 3  
05AC B  0.92 2.05 
01BA A  0.41 5 
01BA B  0.63 1.8 
Z1AC A  0.41 5 
Z1AC B  0.58 1.8 
B2BA A  0.21 6.5 
B2BA B  1.00 1.8 

是否有一个用这种方式“展开”data.tables的标准方法?我很高兴在这种情况下如何使用dplyr,但我怀疑应该有一个data.table方法。

melt()会工作,如果我能弄清楚如何创建列type,例如,

melt(dt, id.vars=c("ID")) 

只会熔化基础上,一列ID

我特别困惑是如何从2-3列一个“擦伤”的A和B型分别列4-5 ...

住,你建议使用melt的方法后,你可以tstrsplit的变量基础上,“_”性格分裂。

## use tstrsplit to split a column on a regular expression 
dt[, c("xy", "type") := tstrsplit(variable, "_")] 
dt 
#  ID variable value xy type 
# 1: 05AC  x_A 0.81 x A 
# 2: 01BA  x_A 0.41 x A 
# 3: Z1AC  x_A 0.41 x A 
# 4: B2BA  x_A 0.21 x A 
# 5: 05AC  y_A 3.00 y A 
# 6: 01BA  y_A 5.00 y A 
# 7: Z1AC  y_A 5.00 y A 
# 8: B2BA  y_A 6.50 y A 
# 9: 05AC  x_B 0.92 x B 
# 10: 01BA  x_B 0.63 x B 
# 11: Z1AC  x_B 0.58 x B 
# 12: B2BA  x_B 1.00 x B 
# 13: 05AC  y_B 2.05 y B 
# 14: 01BA  y_B 1.80 y B 
# 15: Z1AC  y_B 1.80 y B 
# 16: B2BA  y_B 1.80 y B 

这给你所需的解决方案的长形式。然后,您可以使用dcast扩大它

dcast(dt, formula = ID + type ~ xy) 

#  ID type x y 
# 1: 01BA A 0.41 5.00 
# 2: 01BA B 0.63 1.80 
# 3: 05AC A 0.81 3.00 
# 4: 05AC B 0.92 2.05 
# 5: B2BA A 0.21 6.50 
# 6: B2BA B 1.00 1.80 
# 7: Z1AC A 0.41 5.00 
# 8: Z1AC B 0.58 1.80 

这个答案的逻辑是一样的gather %>% separate %>% spread建议dplyr方法,但使用data.table

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感谢您的帮助。稍作纠正:上面的答案输出“ID变量值”。这个问题需要输出为'ID变量x y' – ShanZhengYang

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噢是的 - 我会更新 – SymbolixAU

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@ShanZhengYang请参阅编辑。 – SymbolixAU

dplyrtidyr的组合可以产生您想要的结果。由于缺乏可重现的例子,这未经测试。

library(tidyr) 
library(dplyr) 

dt %>% 
    gather(variable, value, -ID) %>% 
    separate(variable, c("group", "type"), sep = "\\_") %>% 
    spread(group, value, na.rm = TRUE) 

此作用:

  1. 集除了ID列到键值的行,变量和值的所有列。
  2. 将变量列分为组和类型,使用_作为分隔符。
  3. 将组行的内容分散到列中并使用值列填充它们,删除任何NA组合。内data.table