如何读取返回的值（从前一个函数）到熊猫，python？

问题描述：

我想访问/管道下游函数中的一个函数中的数据。

使用Python代码类似如下：

def main(): 
data1, data2, data3 = read_file() 
do_calc(data1, data2, data3) 

def read_file(): 
    data1 = "" 
    data2 = "" 
    data3 = "" 

    file1 = open('file1.txt', 'r+').read() 
    for line in file1 
     do something.... 
     data1 += calculated_values 

    file2 = open('file2.txt', 'r+').read() 
    for line in file1 
     do something... 
     data2 += calculated_values  

    file1 = open('file1.txt', 'r+').read() 
    for line in file1 
     do something... 
     data3 += calculated_values 

    return data1, data2, data3 

def do_calc(data1, data2, data3): 
    d1_frame = pd.read_table(data1, sep='\t') 
    d2_frame = pd.read_table(data2, sep='\t') 
    d3_frame = pd.read_table(data3, sep='\t') 

    all_data = [d1_frame, d2_frame, d3_frame] 

main()

有什么问题给定的代码？看起来熊猫无法正确读取输入文件，但将数据1，2和3的值打印到屏幕上。

read_hdf似乎读取的文件，但不正确。有没有办法将函数直接返回的数据读入熊猫（无需写入/读入文件）。

错误消息：

Traceback (most recent call last): 

    File "calc.py", line 757, in <module> 

    main() 

    File "calc.py", line 137, in main 

    merge_tables(pop1_freq_table, pop2_freq_table, f1_freq_table) 

    File "calc.py", line 373, in merge_tables 

    df1 = pd.read_table(pop1_freq_table, sep='\t') 

    File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 645, in parser_f 

    return _read(filepath_or_buffer, kwds) 

    File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 388, in _read 

    parser = TextFileReader(filepath_or_buffer, **kwds) 

    File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 729, in __init__ 

    self._make_engine(self.engine) 

    File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 922, in _make_engine 

    self._engine = CParserWrapper(self.f, **self.options) 

    File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 1389, in __init__ 

    self._reader = _parser.TextReader(src, **kwds) 

    File "pandas/parser.pyx", line 373, in pandas.parser.TextReader.__cinit__ (pandas/parser.c:4019) 

    File "pandas/parser.pyx", line 665, in pandas.parser.TextReader._setup_parser_source (pandas/parser.c:7967) 

FileNotFoundError: File b'0.667,0.333\n2\t15800126\tT\tT,A\t0.667,0.333\n2\t15800193\tC\tC,T\t0.667,0.333\n2\t15800244\tT\tT,C\......

我将不胜感激任何解释。

（1）我会建议你使用'pd.read_csv（文件1，月= “\ t” 的）'，而不是读表。（2）如果每个文件都包含1列，为什么不直接读入熊猫并进行计算？这会让你的生活比编写一个单独的函数来读取更容易。 – Rohit

答

pd.read_table(data1, sep='\t')认为data1作为文件路径，因为它没有read方法。您可以在堆栈跟踪中看到它尝试使用csv文件内容的名称打开文件。

Parameters 
-------- 
filepath_or_buffer : str, pathlib.Path, py._path.local.LocalPath or any 
object with a read() method (such as a file handle or StringIO)

你应该把它转换为io.StringIO对象，以便它可以读取

的QuickFix：

pd.read_table(io.StringIO(data1), sep='\t')

而是创建一个副本

从 read_table帮助

的数据。最好的解决将是直接创建io.StringIO缓冲区：

def read_file(): 
    data1 = io.StringIO() 


    file1 = open('file1.txt', 'r+').read() 
    for line in file1 
     do something.... 
     data1.write(calculated_values) 

    # in the end 
    data1.seek(0) # reset to start of "file"

如何读取返回的值（从前一个函数）到熊猫，python？

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