R:将模糊名称转换为矩阵中的列
问题描述:
我试图使用"tsne"来分析我的数据。 继“tsne”的“README”中使用的示例数据(“虹膜”), 我试图以可用作tsne()函数输入的方式构建自己的数据。R:将模糊名称转换为矩阵中的列
>sampledata
Gene 1 Gene 2 Gene 3 Gene 4 GeneX
Cell1 Value Value Value Value Value
Cell2 Value Value Value Value Value
Cell3 Value Value Value Value Value
Cell4 Value Value Value Value Value
Cell5 Value Value Value Value Value
与“IRIS”,我想我需要使用dimnames“小区1”,“小区2”,“小区3” 对于数据框中添加一个额外的列比较,我想我可以简单地这样做:
sampledata$sampleids<-rownames(sampledata)
但我不知道如何做类似的技巧矩阵。 感谢您的任何建议。
答
我们可以cbind
但character
基质混合numeric
矩阵character
元结果
sampledata <- cbind(sampledata, sampleids=rownames(sampledata))
如果我们只是想要一些标识,使用行序列标识符,这将是一个数字
sampledata <- cbind(sample(data, sampleids = seq_len(nrow(sampledata)))
我不知道tsne,但矩阵包含相同类型的值。如果它的值是数字,则不能添加字符串。 – user31264
@ user31264,是的,矩阵包含相同类型的值。感谢你提醒我(我刚刚了解到,本周,所以事实还没有在我的脑海中扎根......)。在重新检查“README”部分后,实际上'tsne_out Jun