错误:未定义变量名称
问题描述:
我写了下面的代码,但出现错误:名称'acc'未定义。我如何解决它?错误:未定义变量名称
import csv
with open(r"C:\Users\garfield\Python27\trial.txt") as file, open(r"C:\Users\garfield\Python27\outp.csv", "a+") as f:
x=file.read()
m=x.split()
writer = csv.writer(f, delimiter =",",quoting=csv.QUOTE_MINIMAL)
for i in range(len(m)-1):
if "ACCESSION" in m[i]:
acc=m[i+1]
if '/host' in m[i]:
host1=m[i].split('/host')[1].split('\n')[0]
host2=m[i+1]
host=host1+" "+host2
if "5'UTR" in m[i]:
utr=m[i+1]
data=[acc,host,utr]
writer.writerow(data)
答
从您的代码看起来,你正试图解析完整的文件,从中创建acc
/utr
/host
变量,然后将它写入到CSV,对我来说,它看起来像你想写什么是一个单一的行中的CSV,完整inputfile中后作为被处理,如果是的话,对于线压痕 -
data=[acc,host,utr]
writer.writerow(data)
是错误的,它应在for
循环外被缩进,不里面示例 -
for i in range(len(m)-1):
if "ACCESSION" in m[i]:
acc=m[i+1]
if '/host' in m[i]:
host1=m[i].split('/host')[1].split('\n')[0]
host2=m[i+1]
host=host1+" "+host2
if "5'UTR" in m[i]:
utr=m[i+1]
writer.writerow([acc,host,utr]) #there is no need for an extra variable here.
此外,您应该为所有三个变量设置一些默认值,以处理在文件中找不到特定行的情况。
您应该发布一个MCVE,以便人们可以重现您的问题。但要确保'acc'被定义为导致'data = [acc,host,utr]'的所有路径。 – juanchopanza
您是否试图将单行写入csv? –
你正在做一些奇怪的事情。你阅读整个文件然后分割它。这可能不会做你想做的事情。然后你用'if'检查这三个字符串,但是如果在第一个'm [i]'中找不到它们中的任何一个,你会得到这个错误。即使你没有,我也不确定这是你想要的,因为这些值将一直存在,直到找到另一个字符串(如果你使用字符串作为标志,这是有意义的)。 –