我该如何解决这个c代码/ BLAS错误？

Question

我想写一个使用BLAS LIB来自R

#include <stdio.h> 
#include <R.h> 
#include <R_ext/BLAS.h> 

void foo(int *dimension, double *vect1, double *vect2) 
{ 
    const int dim = dimension[0]; 
    const int incxy = 1; 

    //swaps two vectors 
    F77_NAME(dswap)(&dim,vect1,&incxy,vect2,&incxy); 
} 

交流功能（稍后将R中脚本中使用），我编译使用的代码：

R CMD SHLIB foo.c 

我得到的错误：

foo.o:foo.c:(.text+0x41): undefined reference to `dswap_' 

我在想什么？

Answer 1

它需要链接到任何提供dswap函数。我想这是在R库中。

Answer 2

包含头文件与链接库不相同。

我实际上并不知道有关R的任何信息，但我做了一些搜索并找到了http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html#Creating-shared-objects，这表明您需要BLAS_LIBS变量 - 如果您没有使用makefile，则看起来您只能获取命令的输出“R CMD config BLAS_LIBS”，然后在命令行中包含输出。您可能也可以将其添加到PKG_LIBS变量中，但我对R无法确定足够了解。

编辑：

已设置文件Makevars.win包括

PKG_LIBS=$(BLAS_LIBS) 
PKG_LIBS=$(LAPAK_LIBS) 

这取代与LAPAK_LIBS的PKG_LIBS变量。试用+ =而不是=。

Answer 3

它在这里工作（并请忽略我的~/.R/Makevars选择特定CC和CFLAGS;也忽略次要空白编辑）：

[email protected]:/tmp$ R CMD SHLIB foo.c 
gcc-4.5 -I/usr/share/R/include -fpic -O3 -g0 -Wall -pipe -pedantic -std=gnu99 \ 
     -c foo.c -o foo.o 
gcc -shared -o foo.so foo.o -L/usr/lib64/R/lib -lR 
[email protected]:/tmp$ cat foo.c 
#include <stdio.h> 
#include <R.h> 
#include <R_ext/BLAS.h> 

void foo(int *dimension, double *vect1, double *vect2) 
{ 
    const int dim = dimension[0]; 
    const int incxy = 1; 

    //swaps two vectors 
    F77_NAME(dswap)(&dim,vect1,&incxy,vect2,&incxy); 
} 
[email protected]:/tmp$ 

的Ubuntu 10.10，股票包R，GCC等也许你的[R是在静态库配置中本地构建的？

Answer 4

已设置文件 Makevars.win包括

PKG_LIBS=$(BLAS_LIBS) 
PKG_LIBS=$(LAPAK_LIBS) 

但错误依然存在。

BINGO：加入

"R CMD SHLIB foo.c" 

输出从

"R CMD config BLAS_LIBS" 

在

"R CMD SHLIB foo.c -LC:/PROGRA~1/R/R-212~1.2/bin/i386 -lRblas" 

，现在它的工作原理。