在Linux Mint上无法安装R软件包17
问题描述:
在Linux Mint 17上运行R 3.1.2,当我尝试安装流行的软件包时,出现non-zero exit status
。一个例子install.packages
尝试的完整输出如下:在Linux Mint上无法安装R软件包17
> install.packages("plyr")
Installing package into ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/plyr_1.8.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 393233 bytes (384 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 384 Kb
* installing *source* package ‘plyr’ ...
** package ‘plyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include" -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
/bin/bash: g++: command not found
make: *** [RcppExports.o] Error 127
ERROR: compilation failed for package ‘plyr’
* removing ‘/home/joe_kendrick/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/plyr’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpXe52Mz/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("plyr") :
installation of package ‘plyr’ had non-zero exit status
我得到本质上的其他包我尝试安装,如ggplot2
和vegan
,尽管在许多情况下,它是更冗长,因为它试图和相同的消息未能安装依赖关系。
这似乎是一个有点常见的问题,但其他人似乎有outdatedsoftware或insufficientmemory。我正在运行Mint和R的最新稳定版本,并且我有大量的RAM和交换文件,所以我不认为这些都会导致我的问题。
答
每错误消息
/bin/bash: g++: command not found
你需要安装一个C++编译器。我将与其中的一个开始:
sudo apt-get install build-essentials # key tools
或
sudo apt-get install r-base-dev # many development tools for R
或课程
sudo apt-get install r-cran-rcpp # to not install from source
的虽然RCPP你可能比你需要的一个更老。
对于基于Debian的系统的用户,有一个列表r-sig-debian
。
答
在我的情况下,我正在运行一个相当新的Mint 18安装,并且我错过了某些软件包。根据R中的错误消息,我试图安装“readr”,但是因为我缺少一个底层软件包“libcurl4-openssl-dev”,所以无法安装。我apt-got了,然后readr安装没有错误,现在我的RStudio包按预期加载。
非常感谢将来的读者,'sudo apt-get install r-base-dev'为我打开了诀窍。 – Joe 2014-11-11 03:14:06
伟大的答案@DirkEddelbuettel! – Quantopik 2015-03-16 22:58:33