Rcpp错误:不兼容的类型(从%s到%s)
问题描述:
我最近开始使用Rcpp包将我的R代码段写入C++。给定一个数据矩阵,我有以下Rcpp函数,它可以计算一些观察值的协方差的内核重加估计值。Rcpp错误:不兼容的类型(从%s到%s)
cppFunction('
NumericVector get_cov_1obs(NumericMatrix cdata, int ID, float radius){
int nrow = cdata.nrow(), ncol = cdata.ncol();
float norm_ = 0;
float w;
NumericMatrix out(ncol, ncol);
NumericMatrix outer_prod(ncol, ncol);
for (int i=0; i<ncol;i++){
for (int j=0;j<ncol;j++){
out(i,j) = 0;
outer_prod(i,j) = 0;
}
}
for (int i=0; i<nrow;i++){
w = exp(-(i-ID)*(i-ID)/(2*radius));
norm_ += w;
for (int j=0; j<ncol;j++){
for (int k=0;k<ncol;k++){
outer_prod(j,k) = cdata(i,j) * cdata(i,k);
}
}
for (int j=0; j<ncol;j++){
for (int k=0;k<ncol;k++){
out(j,k) += outer_prod(j,k)*w;
}
}
}
for (int i=0; i<ncol;i++){
for (int j=0;j<ncol;j++){
out(i,j) /= norm_;
}
}
return out;
}')
我想快点估计内核rewieghted协方差matricies对数据集中的所有意见,并将它们存储为一个数组。由于RCPP不处理数组我写了下面的一个R函数:
get_kern_cov_C = function(data, radius){
# data is data for which we wish to estimate covariances
# radius is the radius of the gaussian kernel
# calculate covariances:
kern_cov = array(0, c(ncol(data),ncol(data),nrow(data)))
for (i in 1:nrow(data)){
kern_cov[,,i] = get_cov_1obs(cdata=data, ID = i-1, radius=radius)
}
return(kern_cov)
}
这似乎很好地工作(还有很多,很多快于R)但问题是,每一个现在,然后(似乎是随机的)我得到以下形式的错误:
Error in kern_cov[, , i] = get_cov_1obs(cdata = data, ID = i - 1, radius = radius) :
incompatible types (from X to Y)
其中X或者是内置或NULL和ÿ加倍。
我大致了解为什么会发生这种情况(我试图将一个内置/ NULL变量放入一个double),但我不确定是在代码中的错误。我怀疑这可能与内存管理有关,因为它只会一次又一次地发生。
答
您也可以在C(++)级别测试NULL,在这种情况下可能应该这样做。
至于它为什么会发生:恐怕你需要调试这个。
嗨德克,谢谢你的回复。我对C很陌生,如何去测试NULL? –