将数据从R存储到DB2不起作用
我有一个DB2和R连接的奇怪问题。我可以访问数据库,但可以查询数据但我无法从R存储数据。我使用R的RODBC包。我遵循这里编写的指南https://www.ibm.com/developerworks/data/library/techarticle/dm-1402db2andr/index.html从技术上讲,此包从R对象创建“INSERT INTO”语句,并且在DB2上执行它以存储来自R的数据(我有必要的凭据在数据库上执行这些操作。)将数据从R存储到DB2不起作用
我试过的是以下内容(我使用R和SQuirreL - http://squirrel-sql.sourceforge.net/ - 一起测试多个单向):
使用SQuirreL创建一个包含3列和25条记录的测试表。 然后我从R查询这个表。 我尝试将结果数据集中的第一条记录(从2)保存到同一个表中。 然后我从R中查询表 - 附加行。 然后我从SQuirreL查询。 这里的问题发生在这里,而我连接到R和INSERT后。在(4)我看到添加的记录,但我无法从SQuirreL(5)中查询它。 R似乎锁定了整个桌子。当我用R与数据库断开连接时,它不会得到解决,我还会得到2条错误消息(我怀疑这些错误消息是相关的)。当我退出R然后它解决了,我可以从SQuirreL查询我的表,但附加的记录消失。
我试图从R发送的SQuirreL运行相同的SQL语句。我没有收到错误消息,并且记录被追加。因此R使用的方法应该可以工作。我不知道它在哪里横着。
我附上了我的表和使用的R脚本(包括运行时间消息)的示例数据。以下是CREATE TABLE语句。该表还没有任何索引或键,因此不会禁止添加重复记录。
create table dm_quant.test (
r_date date,
cid varchar(255),
priv_person varchar(255)
);
有没有人遇到同样的困难?如果是这样,我该如何解决它?
提前致谢!
#connect-to-db2
rm(list=ls(all=TRUE))
gc(reset = TRUE)
require(RODBC)
dsn_name <- "DB2_DB"
user <- "user"
pwd <- "pass"
channel <- odbcConnect(dsn = dsn_name, uid = user, pwd)
table_list <- sqlTables(channel, tableType = "TABLE", schema = "DM_QUANT")
cat("There are", nrow(table_list), "tables in the DM_QUANT schema.\n")
# There are 4 tables in the DM_QUANT schema.
table_name <- "DM_QUANT.TEST"
col_list <- sqlColumns(channel, table_name)
cat("There are", nrow(col_list), "columns defined in", table_name,"\n")
# There are 3 columns defined in DM_QUANT.TEST
## Fetch test table (25 records)
test_tbl <- sqlQuery(channel, paste("SELECT * FROM ", table_name, sep = ""),
as.is = TRUE, na.strings = "")
## Determine varTypes parameter for sqlSave
db2_var_types <- data.frame(var = col_list$COLUMN_NAME,
var_type = col_list$TYPE_NAME,
var_type_ext = paste(col_list$TYPE_NAME, "(", col_list$COLUMN_SIZE, ")", sep = ""),
stringsAsFactors = F)
db2_var_types$final_var_type <- db2_var_types$var_type
## Adding size for VARCHAR variable type.
db2_var_types$final_var_type[db2_var_types$var_type == "VARCHAR"] <- db2_var_types$var_type_ext[db2_var_types$var_type == "VARCHAR"]
## Append - append 1st record of the current table again.
sqlSave(channel, test_tbl[1,], tablename = table_name, append = T, verbose = T,
fast = F, rownames = F, colnames = F, varTypes = db2_var_types$final_var_type)
# Query: INSERT INTO DM_QUANT.TEST ("R_DATE", "CID", "PRIV_PERSON") VALUES ('2016-06-30', '193303', 'N')
## After I use sqlSave I cannot query from the database from SQuirreL SQL Client.
## Seems like I'm locking the whole table by R.
## Test append
## customer_test <- sqlFetch(channel, table_name)
test_append <- sqlQuery(channel, paste("SELECT * FROM ", table_name, sep = ""),
as.is = TRUE, na.strings = "")
nrow(test_append)
# [1] 26
nrow(test_append) == nrow(test_tbl) + 1
# [1] TRUE
## Append seems successfull
cat("Record appended successfully.\n")
## Close connections
odbcCloseAll()
cat("Database connections are closed.\n")
## Always closes with 2 error message
# 1: [RODBC] Error in SQLDisconnect
# 2: [RODBC] Error in SQLFreeconnect
## I still cannot query from SQuirreL SQL Client untill I close R completely
## After I close and test query from SQuirreL, I cannot see the appended record.
我用于测试的Excel文件。
**sample-data**
R_DATE CID PRIV_PERSON
2016.06.30 193303 N
2016.06.30 808739 N
2016.06.30 585008 N
2016.06.30 479872 N
2016.06.30 350290 N
2016.06.30 895961 N
2016.06.30 822839 N
2016.06.30 746603 N
2016.06.30 174107 N
2016.06.30 858942 N
2016.06.30 710500 N
2016.06.30 513533 N
2016.06.30 303993 N
2016.06.30 14983 N
2016.06.30 91401 N
2016.06.30 364451 N
2016.06.30 147311 N
2016.06.30 165897 N
2016.06.30 988524 N
2016.06.30 445691 N
2016.06.30 119082 N
2016.06.30 4668 N
2016.06.30 8910 N
2017.12.31 377879
2016.06.30 531661 N
禁用自动提交会解释此行为。更新或插入的行保持锁定状态,直到它们被提交。当您强制关闭连接时,更改可能会回滚。
建立连接后立即尝试odbcSetAutoCommit(channel, autoCommit = TRUE)
。或者,您可以在sqlSave()
后发出odbcEndTran(channel, commit = TRUE)
。
谢谢你的帮助,它解决了这个问题。 – ParraghG