从MatLab调用R脚本 - 错误

问题描述：

我想调用一个R脚本，说myRfile.R，从MatLab。我正在使用Windows 10机器，其中MatLab 2017a和R-3.4.2。我用的是system命令的建议在以前stackoverflow question.解决的办法是做到以下几点：从MatLab调用R脚本 - 错误

添加路径的R安装位置。在我的情况下，我写了 addpath C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin。
确保R脚本位于工作目录（或路径）中。
调用函数system('R CMD BATCH myRfile.R')。

I，然而，得到的错误标志= 1和下面的印刷在命令窗口：

“R”不被识别为内部或外部的命令，可操作的程序或批处理文件。

我检查，以确保我可以从CMD导航到相应的文件并调用运行R.exeR。相反，如果我呼吁通过system：

系统（ ' “C：\ Program Files文件\ r \ R-3.4.2 \ BIN \ 64 \运行R.exe” CMD批 myRfile.R'）; ，

然后脚本正确执行（无错误）。因此，我找到了解决我的问题的方法。但是，我想定义字符串

RPATH = “C：\ Program Files文件\ r \ R-3.4.2 \ BIN \ 64 \运行R.exe”

在开始我的程序并运行命令

system（'Rpath CMD BATCH myRfile.R'）;

这将返回一个类似的错误如前：

“RPATH”不被识别为内部或外部的命令，运行的程序或批处理文件。

问题：

为什么命令system('R CMD BATCH myRfile.R')不适合我？
为什么会出现system命令工作，如果我写R直接作为字符串的目录，但如果我通过通过Rpath给它一个字符串，它不工作？

将“Rpath”放在字符串中间不会传递任何我知道的编程语言中的字符串。使用'sprintf'来生成'system'的字符串参数。 – excaza

当您将R添加到系统路径中时，是否重新启动了matlab？ 'getenv（'PATH'）'包含R目录吗？（[Matlab的“运行外部命令”]（https://www.mathworks.com/help/matlab/matlab_external/run-external-commands-scripts-and-programs.html）页面为您工作吗？ – r2evans

@excaza'系统（'sprintf（Rpath）CMD BATCH Rum_81_genB_VtoH.R'）'不起作用，它返回错误'sprintf'不被识别... –

答

大厦关闭@ r2evans意见，解决办法是使用setenv而非addpath，因为system使用系统路径来搜索文件。 Program和Files之间的空间对于system命令也有问题。

样品溶液：

% Get the current set of system paths 
path1 = getenv('PATH'); 
% Append directory for R to the system path  
path1 = [path1'C:\PROGRA~1\R\R-34~1.2\bin\x64']; 
% Update system path 
setenv('PATH', path1) 
% Run the system command. 
system('R CMD BATCH myRfile.R');

一般情况下，一个方式来获得正确的路径打开R，然后输入命令file.path(R.home())一个实例。对我而言，这返回"C:/PROGRA~1/R/R-34~1.2". Finally, append \ bin \ x64`。

@excaza指出，定义到R的路径的字符串应该被""包围，以便cmd正确解释空格。解决方案2：

path1 = getenv('PATH'); 
% Append directory for R to the system path  
path1 = [path1'"C:\Program Files\R\R-3.4.2\bin\x64"']; 
% Update system path 
setenv('PATH', path1) 
% Run the system command. 
system('R CMD BATCH myRfile.R');

从MatLab调用R脚本 - 错误

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