滥用OpenMP?

问题描述:

我有一个使用OpenMP来并行化for-loop的程序。在循环内部,线程将写入共享变量,所以我需要同步它们。但是,我有时可能会遇到段错误或双重释放或损坏错误。有人知道会发生什么?感谢致敬!下面是代码:滥用OpenMP?

void KNNClassifier::classify_various_k(int dim, double *feature, int label, int *ks, double * errors, int nb_ks, int k_max) { 
    ANNpoint  queryPt = 0;  
    ANNidxArray nnIdx = 0;  
    ANNdistArray dists = 0;  

    queryPt = feature;  
    nnIdx = new ANNidx[k_max];     
    dists = new ANNdist[k_max];    

    if(strcmp(_search_neighbors, "brutal") == 0) {// search 
    _search_struct->annkSearch(queryPt, k_max, nnIdx, dists, _eps); 
    }else if(strcmp(_search_neighbors, "kdtree") == 0) { 
    _search_struct->annkSearch(queryPt, k_max, nnIdx, dists, _eps); // double free or corruption 
    } 

    for (int j = 0; j < nb_ks; j++) 
    { 
    scalar_t result = 0.0; 
    for (int i = 0; i < ks[j]; i++) {   
     result+=_labels[ nnIdx[i] ]; // Segmentation fault 
    } 
    if (result*label<0) 
    { 
    #pragma omp critical 
    { 
     errors[j]++; 
    } 
    } 

    } 

    delete [] nnIdx; 
    delete [] dists; 

} 

     void KNNClassifier::tune_complexity(int nb_examples, int dim, double **features, int *labels, int fold, char *method, int nb_examples_test, double **features_test, int *labels_test) {  
      int nb_try = (_k_max - _k_min)/scalar_t(_k_step);  
      scalar_t *error_validation = new scalar_t [nb_try];  
      int *ks = new int [nb_try];  

      for(int i=0; i < nb_try; i ++){  
      ks[i] = _k_min + _k_step * i;  
      }  

      if (strcmp(method, "ct")==0)                              
      {  

      train(nb_examples, dim, features, labels);// train once for all nb of nbs in ks                         

      for(int i=0; i < nb_try; i ++){  
       if (ks[i] > nb_examples){nb_try=i; break;}  
       error_validation[i] = 0;  
      }  

      int i = 0;  
     #pragma omp parallel shared(nb_examples_test, error_validation,features_test, labels_test, nb_try, ks) private(i)  
      {  
     #pragma omp for schedule(dynamic) nowait  
       for (i=0; i < nb_examples_test; i++)   
       {  
       classify_various_k(dim, features_test[i], labels_test[i], ks, error_validation, nb_try, ks[nb_try - 1]); // where error occurs  
       }  
      }  
      for (i=0; i < nb_try; i++)  
      {  
       error_validation[i]/=nb_examples_test;  
      }  
      } 

      ...... 
    } 

UPDATE:

正如我过去后double free or corruption,代码运行正常用单线程,但给出了多线程运行时错误。该错误随时发生变化。如果我运行两次,其中一次将会出现段错误,另一次将会出现双倍的空闲或腐败现象。

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在段错误之前,i和nnIdx [i]的值是什么? – 2010-02-02 07:09:36

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我是6. nnIdx [i]是1708204069,这是非常错误的,超出了可以被认为合理的方式。不知道为什么。将值分配给nnIdx的元素的函数属于ANN,库为 近似最近邻搜索,请参阅http://www.cs.umd.edu/~mount/ANN/ – Tim 2010-02-02 07:32:40

让我们来看看你的分割断层线:

result+=_labels[ nnIdx[i] ]; 

result是本地的 - 确定。

nnIdx是本地 - 也行。

i是本地 - 仍然可以。

_labels ...这是什么?

它是全球性的吗?你有没有通过#pragma shared定义访问权限?

也是一样的前者:

_search_struct->annkSearch(queryPt, k_max, nnIdx, dists, _eps); 

似乎我们这里有一个问题,是不是容易解决 - _search_struct不是线程安全的 - 大概值它是由线程同时修改。你必须有一个专用的_search_struct每线程,可能是通过在classify_various_k中分配它。

的真正的坏消息却是,ANN可能是完全无螺:

库分配少量的存储量 ,这是通过在 程序的内置所有 搜索struc-功能共享一生。因为共享数据 ,所以在删除所有单个结构 时,不会释放它,甚至不会释放 。

如上所述,并行数据修改总会有问题,因为库本身有一些共享数据 - 因此它本身不是线程安全的:/。

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_labels是类KNNClassifier的数据成员。它并没有明确宣布为共享敌人openmp。此外,如果我运行我的progrom两次,一个将seg段,ang其他将是双重免费或腐败,如在我上一篇文章。即错误不是固定的。 – Tim 2010-02-02 07:08:23

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_search_struct-> annkSearch(queryPt,k_max,nnIdx,dists,_eps)用于在* _search_struct的k-d树中组织的某些点中查找查询点*特征的k_max最近邻点。 k-n邻居的索引存储在nnIdx中,并且它们与查询点的距离为dists。 – Tim 2010-02-02 07:18:19

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@Tim,更新了答案。 – 2010-02-02 08:29:45