使用qsub在另一个bash脚本中调用bash脚本

Question

我想在使用qsub的另一个bash脚本中运行bash脚本（因为我需要在集群上运行实际问题）。

下面是这个问题的演示。我有两个脚本如下：

脚本1：

#!/bin/bash -f 
sh ./script2.sh 

脚本2：

#!/bin/bash 
echo "It works fine!" 

现在，如果我把这两个脚本文件夹中，并使用命令sh script1.sh，它会正常工作。但是，如果使用qsub命令来运行它qsub script1.sh它将通过一个错误：

SH：./script2.sh：没有这样的文件或目录

我怎样才能解决这个问题？

Answer 1

To define the working directory path to be used for the job -d option can be used. If it is not specified, the default working directory is the home directory.

检查您的工作目录。

#!/bin/bash -f 
echo "Working directory is $PWD" 
sh ./script2.sh 

您可以使用-d选项来解决这个问题。

qsub -d <working directory> script1.sh