无法在Google Cloud Datalab中使用graphviz
问题描述:
This是关于使用Google Cloud Datalab可视化网络图的教程。无法在Google Cloud Datalab中使用graphviz
一切工作完美(需要改变 “gcp.bigquery” 到 “datalab.bigquery” 中[25]),直到:
In [35]:
%%bash
/usr/bin/yes | apt-get install graphviz
pip install --upgrade graphviz
/usr/bin/yes | pip uninstall pyparsing
pip install -Iv https://pypi.python.org/packages/source/p/pyparsing/pyparsing-1.5.7.tar.gz
pip install --upgrade pydot
一旦我卸载pyparsing
,画中画命令不能工作,未来2行不能正确执行。
如果我忽略与pyparsing
,只要安装/升级graphviz
和pydot
线,将发生在这一行中的 “在[67]:”:错误
pos=nx.graphviz_layout(gmax, prog='circo')
AttributeError: 'module' object has no attribute 'graphviz_layout'
我不我认为这是一个pyparsing
的问题。也许graphviz
版本是关键,因为本教程是在大约2年前编写的。
有什么想法吗?
由于
答
我基于this * post改变
pos=nx.graphviz_layout(gmax, prog='circo')
到
pos=nx.nx_pydot.graphviz_layout(gmax, prog='circo')
后的网络图显示正确。这需要pydotplus
,所以我还用%%bash
更新了其中一个单元。我跑
%%bash
apt-get update
apt-get install -y graphviz
pip install pydot
pip install graphviz
pip install pydotplus
,而不是
%%bash
/usr/bin/yes | apt-get install graphviz
pip install --upgrade graphviz
/usr/bin/yes | pip uninstall pyparsing
pip install -Iv https://pypi.python.org/packages/source/p/pyparsing/pyparsing-1.5.7.tar.gz
pip install --upgrade pydot
我希望这有助于!
可能重复的[AttributeError:'模块'对象没有属性'graphviz \ _layout'与networkx 1.11](http://*.com/questions/39411102/attributeerror-module-object-has-no-attribute- graphviz的布局与 - networkx) – snakecharmerb