生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

根据表达矩阵做完差异分析之后,就要将差异表达基因的表达情况从表达矩阵中提取出来,制作差异表达矩阵。这个过程非常简单,但是也有一些人问到,就整理了这个教程。

1. 数据准备:原始表达矩阵和差异表达基因

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

这是原始矩阵

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

这是差异基因列表

2.  Vlookup函数匹配

Vlookup函数是Excel中数据匹配的常用函数

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

首先插入一列

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

做个标记

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

插入新的一列

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

输入函数,函数有四个参数,第一个是匹配特征,此处为基因名称

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

匹配范围

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

因为1在第二列,所以第三个参数是2

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

第一个不在差异表达基因列表里,所以是NA,双击右下角填充

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

筛选将匹配到1的选出来,就是差异表达列表里的基因了

生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

复制到新的Excel表,存放成csv格式,就可以绘制热图了。

差异表达分析教程:https://blog.csdn.net/tuanzide5233/article/details/83541443

热图绘制教程:https://blog.csdn.net/tuanzide5233/article/details/83659501