深度学习DL蒙特卡洛法平衡态分子动力学模拟并计算苯酚键值

接上文《用反向传导进行分子动力学模拟并比较NN二甲基苯胺，N甲基苯胺，苯胺，硝基苯的定位效应》继续用神经网络模拟分子，这次计算苯酚

苯酚的网络结构

算出来的数值画成图

深度学习DL蒙特卡洛法平衡态分子动力学模拟并计算苯酚键值 .

对比前面算出来的

深度学习DL蒙特卡洛法平衡态分子动力学模拟并计算苯酚键值

*	NN二甲基苯胺	N甲基苯胺	苯胺	苯酚	硝基苯
左邻位	89<	93<	97=	97	95
右邻位	86<	88<	94>	89	93
左差值	108-89	108-93	99-97	99-97	108-95
*	19>	15>	2=	2	<13
右差值	108-86	108-88	99-94	99-89	108-93
*	22>	20>	5<	10	<15
左间位	86	85	84	89	85
右间位	83	88	84	91	86
对位	83	79	88	86	92
对位-左间位	-3	-6	4	-3	7
对位-右间位	0	-9	4	-5	6
迭代次数	30815373.3	17502289.9	48909319.4	39045559.6	69624372.6
*	NN二甲基苯胺	N甲基苯胺	苯胺	苯酚	硝基苯
AF双键	0.5007>	0.5003>	0.5002	0.5004	<0.5008
DE双键	0.5016>	0.5013>	0.5011>	0.501	0.5007

虽然有些数量的大小关系连不上了，但是比较苯酚和苯胺的数据相近这是合理的，并且苯酚的间位明显大于苯胺的间位，苯胺的邻位强于苯酚，这个体现了从邻对位到间位的一种过渡。

*	苯胺	苯酚
左邻位	97=	97
右邻位	94>	89
左差值	99-97	99-97
*	2=	2
右差值	99-94	99-89
*	5<	10
左间位	84	89
右间位	84	91
对位	88	86
对位-左间位	4	-3
对位-右间位	4	-5
迭代次数	48909319	39045560

具体数据

C=C	C=C	C-H	C-C	C-H
0.49991185	0.50018516	0.49882143	0.5003251	0.49999528
0.50238403	0.50260393	0.49999203	0.50216775	0.49999081
0.50747587	0.50491156	0.49985096	0.50358759	0.49984772
0.50001631	0.50029775	0.49785941	0.49987608	0.49998574
0.50406226	0.50254655	0.49995197	0.49986053	0.49994764
0.50393535	0.50352307	0.49995597	0.50142867	0.49993751
0.5098046	0.5097839	0.49976567	0.50149541	0.49972643
0.50071535	0.50014364	0.49635131	0.49980827	0.49997701
0.50460508	0.50360742	0.49996994	0.50333484	0.49996671
0.49987576	0.5000322	0.49841833	0.50012064	0.49999472
0.50247999	0.50195017	0.4992419	0.50257177	0.49999545
0.50054358	0.50048797	0.49999982	0.50036123	0.49999944
0.50012118	0.50049374	0.49999298	0.50011483	0.49767545
0.5020722	0.50246549	0.49998811	0.50024723	0.49998599
0.50528338	0.50239866	0.49996332	0.50336482	0.49995414
0.50019552	0.50000432	0.49810772	0.50024715	0.49998323
0.49931276	0.49861019	0.49365989	0.50009881	0.49988015
0.50397154	0.50301344	0.49998107	0.49943801	0.49998396
0.50026918	0.50019131	0.49795218	0.5003647	0.49998817
0.50210507	0.50208912	0.49998219	0.50019774	0.49998675
0.50131336	0.50154965	0.49999344	0.50259234	0.49998959
0.50257476	0.50202323	0.49998809	0.50232064	0.49998003
0.50124332	0.50043766	0.49264482	0.50011315	0.49986314
0.50022693	0.49952241	0.49358028	0.49968763	0.49992903
0.50120085	0.5011607	0.49996484	0.50074744	0.49600928
0.50116354	0.50185833	0.49999173	0.49982359	0.49998898
0.50022331	0.50029416	0.49999969	0.50001819	0.49999944
0.50508281	0.50315476	0.49998238	0.50318587	0.4999877
0.50220885	0.50255373	0.49998831	0.50031597	0.49998277
0.50003813	0.50006876	0.49999941	0.49995217	0.49949253
0.50268228	0.50366932	0.49996907	0.49971109	0.49997296
0.50181067	0.50265865	0.49998861	0.49939165	0.4999894
0.50056869	0.50042756	0.49999946	0.50086627	0.49999922
0.5000436	0.50006021	0.49999931	0.50003217	0.49960815
0.50070344	0.5006069	0.49999889	0.50073088	0.49999834
0.50034024	0.50025081	0.49997999	0.50009469	0.49791021
0.50365684	0.50284206	0.49997365	0.50088599	0.49996154
0.50007644	0.49983202	0.49411111	0.50100164	0.49989349
0.50152858	0.50226117	0.49642799	0.50083797	0.49995382
0.50132956	0.50153715	0.49999679	0.501712	0.49999481
0.50009955	0.49994157	0.49999785	0.50093942	0.49924939
0.50384473	0.50403804	0.49997037	0.50009224	0.4999669
0.50361353	0.50304367	0.49997573	0.50261096	0.49997657
0.49981997	0.50063837	0.49173052	0.50120712	0.4998508
0.50832203	0.50689053	0.49985884	0.50123738	0.49980269
0.51064502	0.50966449	0.49972849	0.50014414	0.49964041
0.50247522	0.50300257	0.49998811	0.50242892	0.49998458
0.5004334	0.50006682	0.49998502	0.50194619	0.49831228
0.50076056	0.50097947	0.4999979	0.50114027	0.49999578
0.50212741	0.50228939	0.49999038	0.50063019	0.49998996

平均
0.50218597	0.50193327	0.49895215	0.50090819	0.49972152

C=C	C=C	C-H	C-C	C-H
0.50074955	0.50105859	0.49999538	0.50134265	0.49999476
0.50007523	0.50001224	0.49807169	0.49996515	0.49998853
0.50062347	0.49997332	0.49986587	0.5010733	0.49336724
0.50286452	0.5027986	0.49998529	0.50316325	0.49998357
0.49999522	0.49975183	0.49997152	0.50257249	0.49501969
0.50095081	0.50129388	0.49996084	0.50544342	0.49674623
0.50037749	0.50285057	0.49967892	0.506837	0.49077839
0.50056303	0.50041089	0.49688115	0.49978285	0.49997923
0.50498218	0.50503686	0.49997683	0.50407057	0.49996358
0.50020767	0.4997694	0.49856035	0.50007166	0.4999926
0.49999713	0.50024534	0.49921517	0.50050775	0.49999599
0.49990342	0.50007351	0.49965312	0.50002242	0.49999946
0.50004549	0.49994651	0.49999108	0.5000459	0.49773906
0.49989577	0.50040754	0.49998184	0.50192489	0.49873545
0.49953092	0.5006603	0.49755033	0.50041979	0.49996691
0.50201271	0.50182384	0.49998984	0.50011592	0.49998166
0.50055245	0.50100717	0.49583575	0.5035914	0.49985081
0.50523755	0.50725185	0.49996176	0.50484696	0.49998724
0.50028701	0.50015599	0.49821468	0.50060576	0.49999316
0.50016922	0.50041276	0.49998318	0.502439	0.49758187
0.50225997	0.50258919	0.49999299	0.5024525	0.49999191
0.50005519	0.50011821	0.49758247	0.50056422	0.49998325
0.50015809	0.50020208	0.49243574	0.49984438	0.4998932
0.50091029	0.50074339	0.49428544	0.5009353	0.49991978
0.49879058	0.50084526	0.49995241	0.50790373	0.49738005
0.50031336	0.49951453	0.49998952	0.50160447	0.49794914
0.50002827	0.50010068	0.49999977	0.50029512	0.4996727
0.50050682	0.50012055	0.49790591	0.5004709	0.4999843
0.49969506	0.49964684	0.49998683	0.50207234	0.49804151
0.50002808	0.49999165	0.49999942	0.50007005	0.49962176
0.50134779	0.50068322	0.49996829	0.503625	0.49725833
0.49993775	0.50070645	0.49998252	0.50155561	0.49722874
0.50087426	0.50035727	0.4999055	0.50095964	0.49999833
0.49992095	0.49990176	0.49999921	0.50073545	0.49932447
0.50086445	0.50073101	0.49999911	0.50022236	0.49999843
0.50008344	0.50015774	0.49998242	0.50435477	0.49732668
0.50092874	0.50012845	0.49996886	0.50320317	0.49726329
0.50830952	0.50337213	0.49987889	0.5070004	0.49983927
0.5037688	0.50370267	0.49997019	0.50097538	0.49994797
0.50110242	0.50252172	0.49999518	0.50024837	0.49999528
0.50003698	0.50007653	0.49929653	0.50047539	0.49999577
0.50048048	0.49944595	0.49996026	0.50335017	0.49621157
0.5004967	0.50046168	0.4980705	0.50059979	0.49996929
0.50516093	0.50550291	0.49979234	0.50232321	0.4998067
0.50064416	0.5005132	0.49983382	0.50730965	0.49444511
0.50074847	0.5022052	0.49976108	0.51194199	0.49111857
0.5029675	0.50353563	0.49998992	0.50284675	0.49998696
0.50050453	0.50061281	0.49763357	0.49996394	0.49998264
0.50140507	0.50135236	0.49999779	0.50132192	0.49999627
0.50037201	0.49997309	0.49999185	0.50171589	0.49834946

平均
0.50103443	0.5010951	0.49918866	0.50219568	0.49860252

C=C	C=C	C-OH	C-C	C-H
0.49997699	0.500165	0.49569713	0.50008207	0.49999369
0.4999233	0.5000237	0.5003933	0.50023439	0.49999134
0.48480702	0.48897478	0.50098295	0.50149416	0.47234089
0.49996646	0.50004401	0.49587048	0.50030119	0.49998475
0.50097832	0.50053211	0.50106598	0.49895094	0.49996591
0.5022044	0.50243007	0.50020478	0.49585829	0.49993173
0.50294818	0.50221783	0.50099453	0.49951681	0.49972569
0.49994886	0.50026835	0.49615766	0.49970879	0.49997107
0.50145342	0.50078977	0.50116288	0.49922592	0.49997167
0.50013446	0.50003376	0.50020645	0.50021994	0.49999291
0.50121044	0.502067	0.50278952	0.49997057	0.49999465
0.50015317	0.50010582	0.50009663	0.49980402	0.49999943
0.50028984	0.50008336	0.50200115	0.50051544	0.49858439
0.49946793	0.49953907	0.49240796	0.50042893	0.49998624
0.50043614	0.50038574	0.50061527	0.50131141	0.49996792
0.49735313	0.49720125	0.50042253	0.50006277	0.49228601
0.50749996	0.51252125	0.51690797	0.5103805	0.49988911
0.50011004	0.5004809	0.49220466	0.50101913	0.49998168
0.49949482	0.49913815	0.4777781	0.49970528	0.49998536
0.50018314	0.50059807	0.50033184	0.50030853	0.49997819
0.49966963	0.49959451	0.50046104	0.50014936	0.4999911
0.49971504	0.49997535	0.50069369	0.50087627	0.49998505
0.5008673	0.50131504	0.5018352	0.50143176	0.49988581
0.50056696	0.50063583	0.50137388	0.50108397	0.49990608
0.50650031	0.50752405	0.50506412	0.49856849	0.4999446
0.49956328	0.49966189	0.50065803	0.50042332	0.49998507
0.50000938	0.49993882	0.50002169	0.50002448	0.49999931
0.50287361	0.502502	0.5027471	0.49988967	0.4999853
0.50047757	0.50080298	0.4925504	0.49919547	0.49998448
0.49935522	0.49883311	0.50021297	0.49890119	0.49928932
0.5004157	0.50045571	0.50099017	0.49986983	0.49996826
0.49996863	0.50015162	0.50023854	0.49990619	0.49998603
0.50028091	0.50011637	0.49858671	0.50008955	0.49999873
0.49976893	0.49977011	0.50109451	0.50025249	0.49999875
0.49932684	0.49957898	0.50015912	0.50016562	0.49999855
0.50230692	0.49870255	0.50386452	0.50087014	0.49998024
0.49972544	0.50116876	0.49239951	0.50195475	0.49996809
0.49898041	0.4989052	0.50220394	0.50021894	0.49986162
0.50286349	0.50177081	0.50505207	0.50141757	0.49820501
0.50028311	0.50021839	0.50196254	0.5016059	0.49926241
0.50134039	0.50064275	0.50163921	0.50031287	0.49999676
0.50029471	0.50017704	0.50104788	0.50139059	0.49996084
0.50050522	0.50109012	0.49284854	0.4994148	0.49997939
0.5001194	0.50028843	0.51414093	0.50991089	0.4945291
0.50060155	0.50046218	0.49902413	0.49675772	0.49985775
0.50296982	0.50280913	0.50135084	0.49612032	0.49465361
0.50031806	0.50027788	0.50019318	0.49990887	0.49998257
0.5032994	0.5037573	0.50300744	0.50115113	0.49998658
0.50015185	0.50025719	0.49861399	0.50035897	0.49999695
0.49960334	0.49985634	0.49503006	0.49978747	0.49998981

平均
0.50042525	0.50057681	0.49994715	0.50042215	0.4989528

O-H	C-OH	迭代次数
0.49919373	0.49569713	29298460.00
0.49998796	0.5003933	13289367.00
0.49982549	0.50098295	709556.00
0.49998154	0.49587048	7331565.00
0.49995524	0.50106598	3119886.00
0.49996283	0.50020478	2477556.00
0.4997749	0.50099454	491998.00
0.49997636	0.49615766	5125872.00
0.49997474	0.50116288	4164164.00
0.49999374	0.50020645	21454561.00
0.49999673	0.50278952	40696189.00
0.49999967	0.50009663	474917490.00
0.49999058	0.50200115	12373910.00
0.49642849	0.49240796	8284118.00
0.49996961	0.50061527	3636750.00
0.49998884	0.50042253	9513495.00
0.49990189	0.51690797	964853.00
0.49890541	0.49220466	7884606.00
0.49982067	0.47777809	16439942.00
0.49998861	0.50033184	8723128.00
0.4999919	0.50046104	15737038.00
0.49998219	0.50069369	8686614.00
0.49987255	0.5018352	1288820.00
0.4999314	0.50137388	1556053.00
0.49993846	0.50506412	2601361.00
0.49998683	0.50065803	11724914.00
0.49999967	0.50002169	397194393.00
0.49998223	0.5027471	8269596.00
0.49998517	0.4925504	8064967.00
0.49999909	0.50021297	162872572.00
0.49996866	0.50099017	4228645.00
0.49998808	0.50023854	8921836.00
0.49942979	0.49858671	187173955.00
0.49999932	0.50109451	158518797.00
0.49999915	0.50015912	119699676.00
0.49998472	0.50386452	6869156.00
0.49659097	0.4923995	4063572.00
0.49989926	0.50220394	1051575.00
0.49995458	0.50505207	3317551.00
0.49999648	0.50196254	30174031.00
0.49999764	0.50163921	49136702.00
0.49996384	0.50104788	3330181.00
0.49991152	0.49284854	5310013.00
0.49977012	0.51414093	756003.00
0.49980544	0.49902413	742335.00
0.49971027	0.50135084	419030.00
0.49998781	0.50019318	9854576.00
0.49998724	0.50300744	9332116.00
0.49805927	0.49861399	47352138.00
0.49999108	0.49503006	13132298.00
平均
0.49972563	0.49994715	39045559.6

深度学习DL蒙特卡洛法平衡态分子动力学模拟并计算苯酚键值

相关推荐