python读取CT医学图像
需要安装OpenCV和SimpleItk。
SimpleItk比较简单，直接pip install SimpleItk即可。
代码如下：
- #coding:utf-8
- import SimpleITK as sitk
- import cv2
- #LKDS-00058,-102.655469971,108.188810974,438.759994507,12.2279986879
- if __name__ == '__main__':
- filename = "F:/cancer_solution/data/train_subset00/LKDS-00058.mhd"
- ds = sitk.ReadImage(filename)
- img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds)
- frame_num, width, height = img_array.shape
- outpath = "F:/cancer_solution/out/train/LKDS-00058"
- index = -1
- for img_item in img_array:
- index = index + 1
- cv2.imwrite("%s/%d.png"%(outpath,index),img_item)
- print "done!"
如上所示，就将CT影像解析成了多个单幅图片。
目前还不太理解(x,y,z)坐标是如何对应的。
但祈世间人无病，何愁架上药生尘。癌症，终有一天可以被战胜。