2020常用单细胞数据库汇总

今天总结一下收录有单细胞发表数据的数据库吧,可以帮助大家减少看文献的负担。

 

1. PanglaoDB

2020常用单细胞数据库汇总

以上是该单细胞数据库的界面,左边有不同的检索方式,右面是对该数据库的大致介绍。该数据库的物种虽然只有人和小鼠,Tissue的种类和数目却有很多;我常用的是下载tissue数据,比如我现在要下载10X小鼠肺脏的rawdata文件,操作如下:

首先点击sample

2020常用单细胞数据库汇总

 

分别对speciesprotocol进行选择,然后找到Lung,点击SRA***即可进入rawdata下载目录:

 

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