Vaa3D_SD、SSD指标的来源

之前写了一个博客是matlab计算SD和SSD的,但是没有具体的介绍指标的由来。
https://blog.****.net/jujiyu6446/article/details/102924301

这两个指标是来自于
Peng H , Ruan Z , Long F , et al. V3D enables real-time 3D visualization and quantitative analysis of large-scale biological image data sets[J]. NATURE BIOTECHNOLOGY, 2010, 28(4):348-353.
这篇文章。

Vaa3D_SD、SSD指标的来源

  1. 首先以步长1作为单位resample 两个swc
  2. 计算A中所有点到B 的空间距离的均值 DIV(A,B)
  3. 计算B中所有点到A 的空间距离的均值 DIV(B,A)
  4. SD=()DIV(A,B)+DIV(B,A))/2
    SSD的区别是只计算距离大于2的点的平均距离。