KEGG 下载 Pathway 通路数据
- 进入KEGG物种列表，网址：https://www.kegg.jp/kegg/catalog/org_list.html
-
这里以小鼠为例，点击
Ctrl+F查找物种小鼠的拉丁名Mus musculus这里也可以用
mouse来搜索，不过可以看到在kegg中含有三种鼠的信息。为了信息准确，最好使用拉丁名作为搜索条件。 -
点击
Brite hierarchy -
进入
KEGG Orthology (KO) -
KEGG Orthology 提供了两种可供下载的格式，比如下载
htext格式如果提示连接不到网络，可以多次点击，国外网的原因。。。
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htext格式如下 -
下载
json格式 -
json格式如下，这种格式更适合提取数据