(在线)设计引物
方法一、通过primer bank
1、输入需要设计引物的基因或者序列(here),选择相应的基因名类型以及物种名,然后点击submit
2、尽量选择含有Validation Results的引物选项(有实验验证),Tm值在60左右
点开Validation Results查看实验结果,图示单峰值可用于后续验证,多峰值则无法使用!!!
3、合适的序列然后在NCBI中进行blast-->Nucleotide
把一条引物序列输入后,查看是否有选项需要改变,然后blast
查看有没有想要的基因以及对应的E value 小于等于0.54,若有则可以合成试试能不能用^-^!
方法2、在NCBI中查询相关基因
1、输入相应基因
找到下图中,点击NM_****
点击Pick Primers
查看Tm在60左右,GC%在50多,self3’ complementarity最好是0,0(越小越好)
然后对获得的引物进行blast,观察对应的产物以及E value
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最直接查找引物的方式就是在NCBI中查找有没有含有相关基因引物序列的文章