发送打印输出到python中的新文件?
问题描述:
在我正在制作的程序的这一部分中,我将一个简单的字母序列转换为fasta格式。我需要采用这种fasta格式并放入一个文件格式,以便我可以将它发送到稍后将在代码中出现的程序。在第3行中,我创建了“fasta.txt”。我需要将第8行fastaform的输出放入该文件中。在最后一行,我试图做到这一点,但它不起作用,我不知道如何。我觉得这应该很简单,但我是新手。发送打印输出到python中的新文件?
infname = sys.argv[2]
handle = open(infname, "r")
file = open("fasta.txt", "w")
for line in handle:
linearr = line.split()
seqid = linearr[0]
seq = linearr[1]
fastaform = (">%s\n%s\n" % (seqid,seq))
print fastaform >> "fasta.txt"
答
尝试
file.write(fastaform)
file.close()
谢谢!我应该考虑这样做。 –