如何从多个目录/文件夹合并多个文件

问题描述：

我有300个目录/文件夹，每个目录有两列单个文件（xxx.gz），我想合并所有文件夹中的所有文件在一个文件中。在所有文件中，第一列是相同的标识符（ID）。如何从多个目录/文件夹合并多个文件

如何将所有文件合并为单个文件？

而且我想将每列的标题作为相应目录中文件的名称。

目录名称是：（68a7eb0a-123，b5694957-764等）和文件名是：（a5c403c2,292c4a2f等），目录名称和各自的文件名不一样，我想把文件名称作为头。

all directories 
ls 
6809b1c3-75a5 
68e9b641-0cc9 
71ae07b8-8bde 
b7815cd2-1e69 
.. 
.. 

each directory contain single file: 

cd 6809b1c3-75a5 

ls bd21dc2e.txt.gz

请出示一个例子目录结构和文件内容和预期的最终文件。 –

[阅读所有文件]（http://*.com/questions/11433432/importing-multiple-csv-files-into-r）然后[在列表中合并多个data.frames]（http：// *的.com /问题/ 8091303 /同时合并多数据帧-IN-A-列表）。此解决方案应该根据文件大小和内存而工作。 – zx8754

@mona请使用[“编辑”]（http://*.com/posts/38660539/edit）以更多信息更新您的文章。 – zx8754

答

试试这个：

for i in * ; do for j in $i/*.gz ; do echo $j >> ../final.txt ; gunzip -c $j >> ../final.txt ; done ; done

注释版本：

for i in *      # for each directory under current working directory 
    do        # have nothing else in there 
    for j in $i/*.gz    # for each gzipped file under directories 
    do 
    echo $j >> ../final.txt  # echo path/file to the final file 
    gunzip -c $j >> ../final.txt # append gunzipping the file to the final file 
    done 
done

结果：

$ head -8 ../final.txt 
6809b1c3-75a5/bd21dc2e.txt.gz 
blabla 
whatever 
you 
have 
in 
those 
files

如何从多个目录/文件夹合并多个文件

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