医学分割论文:Automatic Liver and Lesion Segmentation in CT Using Cascaded FCNN and 3D-CRF
医学分割论文:Automatic Liver and Lesion Segmentation in CT Using Cascaded Fully Convolutional Neural Networks and 3D Conditional Random Fields
Auther: Ferdinand Christ, Institution:Technische Universitat Munchen, Publish year: 2016
论文地址:https://arxiv.org/abs/1610.02177v1
github: https://github.com/IBBM/Cascaded-FCN
Key point:
提出了使用全卷积网络(FCN)和三维条件随机场(CRF)对肝脏及其病变进行勾画
FCN采用两个神经网络进行级联,第一级用于肝脏ROI范围分割,第二级用于肝脏病变部位分割
将2D-CNN和3DCRF相结合,作为后处理步骤,提升分割效果和计算速度
data preparation:
取[-100,400]作为窗宽,提升对比度
通过平移,旋转和叠加高斯噪声进行数据增强
method:
3DCRF:
用于解决3D-CNN受GPU硬件制约的问题,用于获取数据集中的三维条件信息
result:
Dice: 0.93~0.94