医学分割论文:Automatic Liver and Lesion Segmentation in CT Using Cascaded FCNN and 3D-CRF

医学分割论文:Automatic Liver and Lesion Segmentation in CT Using Cascaded Fully Convolutional Neural Networks and 3D Conditional Random Fields

Auther: Ferdinand Christ, Institution:Technische Universitat Munchen, Publish year: 2016

论文地址:https://arxiv.org/abs/1610.02177v1

github: https://github.com/IBBM/Cascaded-FCN

Key point:

提出了使用全卷积网络(FCN)和三维条件随机场(CRF)对肝脏及其病变进行勾画
FCN采用两个神经网络进行级联,第一级用于肝脏ROI范围分割,第二级用于肝脏病变部位分割
将2D-CNN和3DCRF相结合,作为后处理步骤,提升分割效果和计算速度

data preparation:

取[-100,400]作为窗宽,提升对比度
通过平移,旋转和叠加高斯噪声进行数据增强

method:

医学分割论文:Automatic Liver and Lesion Segmentation in CT Using Cascaded FCNN and 3D-CRF

3DCRF:

用于解决3D-CNN受GPU硬件制约的问题,用于获取数据集中的三维条件信息

result:

Dice: 0.93~0.94